多肽阵列
多肽阵列芯片的原理类似于酶联免疫吸附测定(ELISA)。将成千上万的多肽通过化学交联、物理吸附等方法固定在玻璃、硅等材质的基片表面。然后将芯片与各种生物样品,如纯化的酶、抗体、患者或动物血清、细胞裂解液等进行孵育,样品中的目标分子会与芯片上的多肽发生特异性结合。结合后的复合物通过标记依赖的方式进行检测,如利用带有荧光标记的二抗与结合在多肽上的目标分子结合,再通过荧光扫描仪检测荧光信号,从而实现对蛋白质 - 多肽或蛋白质 - 蛋白质相互作用的研究。
制备流程
- 设计与规划:明确研究目标后,通过生物信息学分析设计合理的微阵列布局和多肽特征序列。比如Overlap
- 基片选择与处理:常用玻璃、硅等作为基片,需经过清洁、活化等处理,以利于多肽固定。
- 多肽合成与纯化:通常采用固相肽合成法等化学合成方法制备多肽,再通过高效液相色谱等手段纯化。
- 多肽固定化:可采用化学交联法、物理吸附法或生物亲和法等,将多肽固定在基片上。
- 阵列构建与检测:通过显微操作、喷墨打印等技术将多肽点样在基片上形成微阵列,然后利用荧光检测、质谱分析等方法进行定性和定量分析。
主要优势
- 易于合成:相比蛋白质芯片,多肽的合成相对容易,成本较低。
- 稳定性好:多肽的物化性质较为稳定,芯片的保存期限较长。
- 高通量检测:能够一次性对大量多肽探针进行检测,也可以大批量蛋白和多肽芯片实现高通量检测,筛选靶点多肽或者互作片段肽。
- 特异性强:可以在表位水平上研究分子间的相互作用,信号特异性高。
应用领域
- 基础研究:用于酶的表征,如激酶、磷酸酶等;鉴定抗体表位,确定与蛋白结合的关键基团等。
- 临床应用:可用于发现血液标志物,开发诊断工具和疫苗等。
- 药物研发:筛选与靶点蛋白相互作用的多肽,用于开发多肽药物,还可用于研究药物与蛋白质的结合机制等。